Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhdc3Q8VEM9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Klhdc3Q8VEM9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhdc3Q8VEM9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhdc3Q8VEM9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhdc3Q8VEM9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhdc3Q8VEM9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhdc3Q8VEM9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhdc3Q8VEM9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klhdc3Q8VEM9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhdc3Q8VEM9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhdc3Q8VEM9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhdc3Q8VEM9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhdc3Q8VEM9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhdc3Q8VEM9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhdc3Q8VEM9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms