Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc115Q8VE99 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms