Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RttnQ8R4Y8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms