Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim29Q8R2Q0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim29Q8R2Q0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms