Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K8

Uncharacterized protein C1orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R2K8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8R2K8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R2K8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms