Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg10Q8R1P4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms