Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rdh16f2Q8K3M1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rdh16f2Q8K3M1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rdh16f2Q8K3M1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rdh16f2Q8K3M1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rdh16f2Q8K3M1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rdh16f2Q8K3M1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rdh16f2Q8K3M1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rdh16f2Q8K3M1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Rdh16f2Q8K3M1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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