Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk5rap2Q8K389 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms