Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek9Q8K1R7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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