Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1Q8K158 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms