Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmbrd1Q8K0B2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms