Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms