Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms