Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc17Q8CE13 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc17Q8CE13 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc17Q8CE13 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc17Q8CE13 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms