Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacnb2Q8CC27 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb2Q8CC27 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb2Q8CC27 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb2Q8CC27 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb2Q8CC27 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb2Q8CC27 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb2Q8CC27 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms