Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms