Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dclre1bQ8C7W7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms