Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim35Q8C006 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim35Q8C006 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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