Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nhlrc2Q8BZW8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms