Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ss18l1Q8BW22 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ss18l1Q8BW22 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ss18l1Q8BW22 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ss18l1Q8BW22 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ss18l1Q8BW22 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l1Q8BW22 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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