Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcgF3Q8BTQ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms