Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms