Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan12Q8BKT6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms