Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms