Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdca8Q8BHX3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms