Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Slc5a7Q8BGY9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Slc5a7Q8BGY9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Slc5a7Q8BGY9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a7Q8BGY9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Slc5a7Q8BGY9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Slc5a7Q8BGY9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Slc5a7Q8BGY9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a7Q8BGY9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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