Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp4f39Q8BGU0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms