Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Htatsf1Q8BGC0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms