Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms