Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cracr2bQ80ZJ8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms