Protein–RNA interactions for Protein: Q80YF6

Upk3b, Uroplakin-3b, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bQ80YF6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk3bQ80YF6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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