Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thnsl2Q80W22 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thnsl2Q80W22 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms