Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms