Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN98

Cpeb4, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb4Q7TN98 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpeb4Q7TN98 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpeb4Q7TN98 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms