Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eci3Q78JN3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms