Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms