Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LcorQ6ZPI3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorQ6ZPI3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms