Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja6Q6S5G4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms