Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HjurpQ6PG16 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms