Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim45Q6PFY8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim45Q6PFY8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms