Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop58Q6DFW4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop58Q6DFW4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms