Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx11Q6AXC6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx11Q6AXC6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms