Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sv2cQ69ZS6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms