Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4fQ66X05 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms