Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprdQ64487 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprdQ64487 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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PtprdQ64487 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PtprdQ64487 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtprdQ64487 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtprdQ64487 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtprdQ64487 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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PtprdQ64487 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprdQ64487 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprdQ64487 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprdQ64487 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprdQ64487 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprdQ64487 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprdQ64487 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprdQ64487 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprdQ64487 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprdQ64487 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprdQ64487 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprdQ64487 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprdQ64487 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprdQ64487 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprdQ64487 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprdQ64487 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprdQ64487 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprdQ64487 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprdQ64487 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprdQ64487 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprdQ64487 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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