Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms