Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms