Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vat1Q62465 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms