Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20854Q62461 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20854Q62461 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms