Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20865Q62460 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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